Organami Instytutu są:

• Dyrektor Instytutu — kompetencje
• Rada Instytutu — skład — regulamin
  

Dyrektor Instytutu posiada uprawnienia do reprezentowania Instytutu w stosunkach cywilno-prawnych i zarządzania Instytutem.

Rada Instytutu jest ustawowym organem reprezentującym całą załogę Instytutu i jest uprawniona do zajmowania stanowiska we wszystkich sprawach dotyczących działalności Instytutu.

Organy Instytutu samodzielnie podejmują decyzje oraz inicjują, organizują i wspomagają działalność Instytutu zgodnie z przepisami prawa i w zakresie przysługujących im kompetencji.