Pełnomocnik ds. Ochrony Informacji Niejawnych Instytutu realizuje zadania wynikające z przepisów o ochronie informacji niejawnych, przy udziale wyznaczonych pracowników, w szczególności:

w zakresie bezpieczeństwa fizycznego:

• opracowuje dokumentacje dotyczącą bezpieczeństwa fizycznego informacji niejawnych;
• realizuje zadania wynikające z planu ochrony informacji niejawnych;
• prowadzi kontrole w zakresie przestrzegania przepisów o ochronie informacji niejawnych, ewidencji, materiałów i obiegu dokumentów;

w zakresie bezpieczeństwa osobowego:

• prowadzi zwykłe i kontrolne postępowania sprawdzające w stosunku do pracowników Instytutu, dla których niezbędne jest posiadanie uprawnień do dostępu do informacji o klauzuli „poufne”;
• prowadzi podstawowe i okresowe szkolenia w zakresie ochrony informacji niejawnych pracowników Instytutu;

w zakresie bezpieczeństwa przemysłowego:

• informuje ABW o wszelkich zmianach w zakresie informacji podanych w kwestionariuszu bezpieczeństwa przemysłowego;
• przekazuje informacje dotyczące umów związanych z dostępem do informacji niejawnych.